CEDES nace el 30 agosto 1996 por la necesidad de continuar ofreciendo los programas de formación de Auxiliares en Salud, que se desarrollaban con la Dirección Seccional de Salud de Antioquia y que en ese año se dejaron de ofrecer por reestructuración en el Departamento. Es así como en el mes de febrero de 1997 se recibieron las aprobaciones para los 16 programas de auxiliares en Salud que en ese momento se tenían y se empezaron a ofrecer en la sede principal del municipio de Rionegro.

Se fue cualificando la actividad empresarial y académica y en el 2007 se presentaron los nuevos cinco currículos definidos por el Ministerio de Salud, como únicos para el sector y en el año 2009 se recibieron los acuerdos de aprobación para estos programas.

Desde el año 2008 evidenciamos la importancia de implementar el Sistema de Gestión de la Calidad en la institución, buscando siempre el mejoramiento continuo y la prestación del servicio educativo con calidad. Con el apoyo del Ministerio de Educación, se inició con la formación de las directivas en el Sistema de Gestión de la Calidad, a la vez que se iba realizando la implementación del sistema en la institución.

En el año 2010 se recibieron las certificaciones de calidad en ISO 9001 y en las normas técnicas NTC 5555, certificación para las Instituciones de Educación para el Trabajo y el Desarrollo Humano y la NTC 5663 para los programas de formación en el área de la salud, para la sede de Rionegro. El sistema se ha mantenido y su eficacia y grado de conformidad con los criterios de las normas, son evaluados a través de las auditorías de seguimiento y auditorías internas.

Con una trayectoria de 20 años en el mercado en la prestación de servicios Educativos y Desarrollo Social, el Centro de Educación en Salud CEDES, cumple con todos los requerimientos legales exigidos para la prestación de dichos servicios, en condiciones de alta calidad y competitividad, razón por la cual es reconocida como una institución líder en la formación de capital humano para el trabajo y en la realización de convenios de cooperación interinstitucional e intersectorial para el fomento del desarrollo social, la equidad y el desarrollo humano integral.

En la actualidad, la institución cuenta con una sede principal ubicada en el municipio de Rionegro y seccionales en los municipios de Medellín, Yarumal y Yolombó, que garantizan la cobertura para la prestación de los servicios educativos en las subregiones de influencia de estos municipios, lo que le ha permitido a CEDES el posicionamiento y el reconocimiento en los niveles nacional, departamental y regional por la calidad de sus servicios, la competitividad laboral de sus egresados y la efectiva respuesta a los cambios en el sector educativo, productivo y social.